Порядок обучения должен проходить поступательно, последующая ступень обучения вытекает из предыдущей. В рейки всего три ступени обучения. Каждая ступень обучения сама по себе является вполне завершенным курсом. Для овладения Рейки нет необходимости завершать все ступени обучения.

Некоторые проходят только первую ступень, другие получают две ступени, и совсем незначительное количество имеют желание изучить третью ступень.

Первая ступень

Это начальный этап обучения. Его может получить любой желающий. Уже после него, прошедший обучение, сможет помогать себе и самоисцеляться. Эта ступень предоставляет студентам общие понятия о Рейки. Первая ступень позволяет помогать себе и другим методом наложения рук.

На первой ступени мастер дает студенту четыре настройки, в результате которых студент может быть проводником потоков Рейки и таким образом самоисцеляться и исцелять других.

Вторая ступень
В 
Вторую ступень может получить тот, кто прошел первую ступень. Оптимальное время между ступенями является 3-4 месяца, что позволяет человеку принять энергетику первой ступени и правильно оценить ее характер. После принятия энергетики, способности и баланса, можно переходить на новую ступень (желательным является приобретение практического опыта на этом этапе).

Зачастую вторая ступень считается уровнем профессионала-целителя.

Некоторые на этом уровне начинают заниматься профессионально, хотя чтобы стать настоящим профессионалом, нужно получить практический опыт. Обучение же дает только дополнительные навыки, которые можно применять в более сложных и эффективных формах Рейки. Для желающих продолжить работать с друзьями и семьей, оно даст новые инструменты и возможности.

Третья ступень - мастер

После прохождения первой и второй ступеней обучения и активного использования Рейки можно приступать к третьей ступени.

После инициации во 2-ю ступень должно пройти больше полугода, и не меньше 2-3 лет между 1-й и 3-й ступенями. Время между ступенями во многом зависит от кандидата, от того насколько он прилежен в изучении и применении знаний Рейки. В некоторых случаях требуется дополнительно поработать перед началом обучения.